En una aldea tranquila, un joven llamado Duanmu Yeyu fue salvado por los "Cazadores del Infierno" de Ciudad Ember. Profundamente inspirado por estos héroes, juró convertirse algún día en un Cazador del Infierno. Mientras subía a un autobús hacia Ciudad Ember para perseguir su sueño, Yeyu se vio arrastrado sin saberlo a una tormenta de caos. El antagonista principal, Lucifer, envió a una agente de bioingeniería llamada MIKO-Taiyi para infiltrarse en Ciudad Ember y robar información clasificada. Durante una feroz batalla contra los Cazadores del Infierno, Taiyi resultó gravemente herido y cayó inconsciente. Yeyu se topó con Taiyi y, sin saber su identidad, lo llevó de vuelta a la base de los Cazadores del Infierno para que recibiera tratamiento. En el proceso, Yeyu, sin querer, le arrebató un dispositivo crucial a Taiyi. Mientras Yeyu comenzaba su tan esperada prueba para unirse a los Cazadores del Infierno, su inocente acto desencadenó una reacción en cadena. Taiyi, desesperado por evitar ser detectado por las fuerzas de Ciudad Ember, tuvo que acercarse sigilosamente a Yeyu y recuperar el dispositivo. Mientras tanto, Lucifer envía decenas de miles de secuaces a localizar a Taiyi, el desaparecido. Así comienza un conflicto en toda la ciudad, desencadenado por un pequeño acto de bondad, que amenaza con convertirse en una batalla por la supervivencia de Ember City